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一種特異性結(jié)合新城疫病毒的核酸適配體及其篩選方法和應(yīng)用與流程

文檔序號(hào):11506056閱讀:1497來源:國知局
一種特異性結(jié)合新城疫病毒的核酸適配體及其篩選方法和應(yīng)用與流程

本發(fā)明屬于分子生物學(xué)領(lǐng)域,更具體地,涉及一種特異性結(jié)合新城疫病毒的核酸適配體及其篩選方法和應(yīng)用。



背景技術(shù):

新城疫(newcastledisease,nd)是由新城疫病毒(newcastlediseasevirus,ndv)引起的一種高度接觸性、致死性的烈性傳染病,禽類感染后以呼吸道、消化道和中樞神經(jīng)系統(tǒng)損傷為主要特征。ndv屬于副黏病毒科,為單股、不分節(jié)段、有囊膜的負(fù)鏈rna病毒,基因組結(jié)構(gòu)為3′-np-p-m-f-hn-l-5′,編碼6種結(jié)構(gòu)蛋白,目前只有一個(gè)血清型。該病呈世界性分布,給養(yǎng)禽業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。對(duì)于多數(shù)國家養(yǎng)禽業(yè),不僅因暴發(fā)新城疫導(dǎo)致巨大的經(jīng)濟(jì)損失,而且控制本病成本較高。免疫接種是預(yù)防新城疫的有效手段,但需要反復(fù)監(jiān)測(cè),成本較高。

核酸適配體,也稱適配子或適配體,作為“化學(xué)抗體”,能夠特異性識(shí)別和結(jié)合靶分子。1990年,tuerk利用體外篩選技術(shù)獲得能與t4dna聚合酶特異性結(jié)合的rna,并把該技術(shù)定義為指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù)(systematicevolutionofligandsbyexponentialenrichment,selex)。同年,ellington發(fā)現(xiàn)了能與小分子有機(jī)染料結(jié)合的rna片段,將其命名為核酸適配體(aptamer)。適配體是一段具有特定三維構(gòu)象的單鏈寡核苷酸,長度一般在60~100nt,通過指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù),從人工合成的隨機(jī)核苷酸序列文庫中經(jīng)過多輪篩選分離,獲得能與靶分子高特異性和高親和力結(jié)合的寡核苷酸序列。適配體是以其穩(wěn)定的三維構(gòu)象為基礎(chǔ),主要包括發(fā)夾結(jié)構(gòu)、莖、三重體、假結(jié)體和g-四聯(lián)體。通過自身構(gòu)象變化和三維折疊形成能與靶分子特異性結(jié)合的位點(diǎn)。核酸分子在儲(chǔ)存、運(yùn)輸、處理和表達(dá)遺傳信息的生物過程中發(fā)揮重要作用,而適配體因其與靶分子分子具有特異性親和識(shí)別的性質(zhì),拓寬了人們對(duì)核酸作為傳統(tǒng)遺傳物質(zhì)的概念認(rèn)識(shí)。適配體作為“化學(xué)抗體”,可作為功能阻斷劑影響病毒的復(fù)制和翻譯等過程,進(jìn)而阻止疾病的發(fā)生;此外,適配體也可以替代抗體的特定功能,用于相關(guān)病毒病的檢測(cè)。近年來,適配體被廣泛作為理想的識(shí)別元件用于目標(biāo)分子的檢測(cè)。適配體識(shí)別靶物質(zhì)的模式與傳統(tǒng)的抗體識(shí)別模式類似,與傳統(tǒng)的抗體相比,核酸適配體具有更多的優(yōu)勢(shì),如表1所示。

表1適配體與抗體的特點(diǎn)比較

目前,各種改進(jìn)的selex篩選方法層出不窮,至今沒有固定標(biāo)準(zhǔn)。將篩選用的文庫和靶分子按一定比率混合,并選擇合適的條件(介質(zhì)、溫度、緩沖體系、時(shí)間等進(jìn)行孵育),該步驟雖然簡(jiǎn)單,但是不同條件會(huì)影響篩選的效率與配基的親和力。如何獲得具有更高特異性和親和力的適配體,剔除非特異性序列和特異性較差的序列,提高篩選的效率是亟待努力解決的問題。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明要解決的技術(shù)問題是克服現(xiàn)有蛋白抗體的技術(shù)不足,提供一種具有與靶分子高親和力、高特異性結(jié)合、易獲得、其過程不依賴動(dòng)物、細(xì)胞和內(nèi)環(huán)境、制備周期短,成本低、比抗體更穩(wěn)定,重復(fù)性好的特異性結(jié)合新城疫病毒的核酸適配體。

本發(fā)明另一個(gè)目的是提供上述核酸適配體的篩選方法。

本發(fā)明再一個(gè)目的是提供上述核酸適配體在檢測(cè)新城疫病毒中的應(yīng)用。

本發(fā)明上述目的通過以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn):

一種特異性結(jié)合新城疫病毒的核酸適配體,所述核酸適配體的序列如seqidno.1所示。

所述核酸適配體的核苷酸序列上的兩端位置被氨基化、羧基化、巰基化或同位素化。

所述核酸適配體的核苷酸序列上結(jié)合熒光標(biāo)記物、生物素修飾、納米發(fā)光材料或酶標(biāo)記。

上述特異性結(jié)合新城疫病毒的核酸適配體的篩選方法,包括如下步驟:

s1.合成隨機(jī)核酸dna文庫和用于pcr擴(kuò)增的上游引物和上游引物:

隨機(jī)核酸文庫序列如seqidno.1所示;

上游引物f序列如seqidno.2所示;

下游引物r序列如seqidno.3所示;

生物素修飾上游引物biotin-f如seqidno.4所示;

s2.篩選核酸適配體:將步驟s1中隨機(jī)核酸文庫與靶分子進(jìn)行孵育,用硝酸纖維素濾膜進(jìn)行分離,得到與靶分子結(jié)合的寡核苷酸,即為篩選所得的特異性結(jié)合新城疫病毒的核酸適配體文庫;

s3.擴(kuò)增核酸適配體文庫:利用s1中合成的引物,將s2所得的寡核苷酸進(jìn)行pcr擴(kuò)增,得到雙鏈dna;

s4.制備單鏈dna文庫:以s3所得的雙鏈dna為模板,利用上游和下游引物,以s3中得到的雙鏈dna為模板,用不對(duì)稱pcr方法擴(kuò)增制備單鏈dna,通過乙醇沉淀方式回收擴(kuò)增的單鏈dna文庫;

s5.重復(fù)篩選:將步驟s4中的單鏈dna文庫替代步驟s2中的隨機(jī)文庫,并重復(fù)上述步驟s2-s4的過程至少5次;

s6.反篩:將步驟s5篩選得到的單鏈dna文庫與非靶分子15℃~37℃孵育30min,用微孔板進(jìn)行分離,得到與靶分子沒有結(jié)合的寡核苷酸;

s7.將s6得到的寡核苷酸作為模板,重復(fù)s3-s4步驟,制備下一輪篩選用的次級(jí)文庫制備;

s8.循環(huán)篩選:以步驟s7中的次級(jí)文庫替代s2中的隨機(jī)核酸文庫,重復(fù)上述步驟s2-s7至10次,得到特異性結(jié)合新城疫病毒gm株的單鏈dna文庫;以biotin-f和r為引物,每輪篩選得到的次級(jí)文庫為模板,擴(kuò)增得到生物素修飾單鏈dna,用elisa法測(cè)定單鏈dna文庫與靶分子的親和性,直至滿足親和力要求后,將所得產(chǎn)物經(jīng)克隆測(cè)序分析,最終得到核酸適配體。

優(yōu)選地,步驟s2中所述靶分子為新城疫h(yuǎn)n蛋白或新城疫病毒gm,步驟s6中所述非靶分子為禽流感病毒、spf雞胚尿囊液或牛血清白蛋白。

優(yōu)選地,步驟s2中所述孵育的時(shí)間為15~60min;步驟s6中所述孵育的時(shí)間為30min。

優(yōu)選地,步驟s3中所述制備雙鏈dna時(shí),pcr的工藝條件為:94℃預(yù)變性5min,94℃變性30s,65℃退火30s,72℃延伸30s,最后72℃延伸7min,擴(kuò)增9~15個(gè)循環(huán)。

優(yōu)選地,步驟s4中所述不對(duì)稱pcr制備單鏈dna時(shí),上下游引物含量比為50~100:1。

優(yōu)選地,步驟s4中所述制備單鏈dna時(shí),pcr的工藝條件為:94℃預(yù)變性5min,94℃變性30s,65℃退火30s,72℃延伸30s,最后72℃延伸7min,擴(kuò)增30~40個(gè)循環(huán)。

另外,上述的核酸適配體在檢測(cè)新城疫病毒中的應(yīng)用也在本發(fā)明的保護(hù)范圍內(nèi)。適配體b53具有抑制病毒復(fù)制、血凝活性和形成蝕斑的能力,能夠特異性識(shí)別hn蛋白和新城疫病毒gm株,而對(duì)禽流感病毒、傳染性法氏囊病毒和spf雞胚尿囊液無反應(yīng)性,可用于檢測(cè)新城疫病毒。

本發(fā)明首先在體外合成總長度為81nt的ssdna文庫,兩端為用于pcr擴(kuò)增的固定序列,中間為40nt的隨機(jī)序列。利用page和變性page分析pcr條件優(yōu)化結(jié)果,進(jìn)而確定了pcr的退火溫度、循環(huán)數(shù)以及不對(duì)稱引物含量。以原核表達(dá)的新城疫h(yuǎn)n蛋白和新城疫病毒gm株為靶分子,利用硝酸纖維素膜過濾法篩選和微孔板法反篩,經(jīng)過10輪的反復(fù)篩選,獲得特異性結(jié)合hn蛋白和新城疫病毒gm株的適配體。使用dnaman軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,并利用mfold預(yù)測(cè)其二級(jí)結(jié)構(gòu)。利用elisa和dotblot試驗(yàn)分析適配體的親和力和特異性,并通過血凝抑制試驗(yàn)和蝕斑抑制試驗(yàn)分析適配體生物學(xué)活性。結(jié)果表明,特異性結(jié)合新城疫病毒的核酸適配體具有與靶分子高親和力、高特異性結(jié)合、易獲得、其過程不依賴動(dòng)物、細(xì)胞和內(nèi)環(huán)境、制備周期短,成本低、比抗體更穩(wěn)定,重復(fù)性好的特點(diǎn),可用于檢測(cè)新城疫病毒。

目前各種改進(jìn)的selex篩選方法將篩選用的文庫和靶分子按一定比率混合,并選擇合適的條件(介質(zhì)、溫度、緩沖體系、時(shí)間等進(jìn)行孵育),該步驟雖然簡(jiǎn)單,但不同條件會(huì)影響篩選的效率與配基的親和力。本發(fā)明在硝酸纖維素濾膜方法的基礎(chǔ)上做出如下改進(jìn):采用硝酸纖維素濾膜和微孔板結(jié)合的selex方法,通過交替使用不同孵育介質(zhì),以獲得具有更高特異性和親和力的適配體。逐漸調(diào)整篩選條件,如減少靶分子和次級(jí)文庫的投入量,縮短孵育時(shí)間等,以獲得與靶分子結(jié)合力更強(qiáng)的寡核苷酸,比抗體更穩(wěn)定,重復(fù)性好,可有效降低實(shí)際生產(chǎn)中批次間的差異。適當(dāng)?shù)姆春Y步驟,有利于非特異性序列和特異性較差序列的剔除,提高了篩選的效率。

與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有以下有益效果:

1.本發(fā)明采用硝酸纖維素濾膜和微孔板結(jié)合的selex篩選方法,通過交替使用不同孵育介質(zhì),篩選獲得具有更高特異性和親和力的新城疫病毒的核酸適配體b53。該適配體b53具有抑制病毒復(fù)制的能力、血凝抑制活性和形成蝕斑的能力,能夠減少44.2%的gm株病毒蝕斑;能夠特異性識(shí)別新城疫h(yuǎn)n蛋白和新城疫病毒gm株,而對(duì)禽流感病毒、傳染性法氏囊病毒和spf雞胚尿囊液無反應(yīng)性,可用于檢測(cè)新城疫病毒。

2.本發(fā)明通過體外篩選過程進(jìn)化,其過程不依賴動(dòng)物、細(xì)胞和內(nèi)環(huán)境;制備周期短,成本低且易獲得;通過減少靶分子和次級(jí)文庫的投入量,縮短孵育時(shí)間等逐漸優(yōu)化篩選條件,以獲得與靶分子結(jié)合力更強(qiáng)的寡核苷酸。比抗體更穩(wěn)定,重復(fù)性好,可有效降低實(shí)際生產(chǎn)中批次間的差異;同時(shí),采用增加反篩過程,也利于剔除非特異性序列和特異性較差的序列,提高了篩選的效率。篩選得到的特異性結(jié)合新城疫病毒的適配體可為新城疫病毒的檢測(cè)及治療提供一個(gè)新思路。

附圖說明

圖1是selex篩選獲得的適配體b53的一級(jí)和二級(jí)結(jié)構(gòu),其中,a圖表示適配體的一級(jí)結(jié)構(gòu),b圖表示適配體的二級(jí)結(jié)構(gòu)。

圖2是每輪篩選得到的ssdna文庫親和力測(cè)定結(jié)果。

圖3是selex篩選獲得的適配體b53的elisa檢測(cè)結(jié)果,其中,a圖表示適配體對(duì)新城疫病毒不同毒株f48e9、gm和lasota的親和力;b圖表示適配體對(duì)不同病毒的親和力。

圖4是selex篩選獲得的適配體b53的dot-blot檢測(cè)結(jié)果。a圖表示適配體對(duì)新城疫病毒不同毒株f48e9、gm和lasota的結(jié)果;b圖表示適配體對(duì)不同病毒的結(jié)果。

圖5是selex篩選獲得的適配體b53的dot-blot分析結(jié)果。

圖6是selex篩選獲得的適配體b53的血凝抑制試驗(yàn)結(jié)果。

圖7是selex篩選獲得的適配體b53的蝕斑抑制試驗(yàn)結(jié)果。

具體實(shí)施方式

下面結(jié)合附圖說明和具體實(shí)施例進(jìn)一步說明本發(fā)明的內(nèi)容,但不應(yīng)理解為對(duì)本發(fā)明的限制。除非特別說明,本發(fā)明采用的試劑、方法和設(shè)備為本技術(shù)領(lǐng)域常規(guī)試劑、方法和設(shè)備。

實(shí)施例1.新城疫病毒核酸適配體的體外篩選

s1.構(gòu)建合成長度為81nt的隨機(jī)核酸文庫,序列如seqidno.1所示,5'-ccggaattcctaatacgactc–(n)40–tattgaaaacgcggccgcgg-3';其中,兩端分別為20和21個(gè)堿基的固定序列,中間40個(gè)堿基為隨機(jī)序列。

合成用于pcr擴(kuò)增的上游引物f和下游引物r的序列為:

上游引物f:5'-ccggaattcctaatacgactc-3',如seqidno.2所示;

下游引物r:5'-ccgcggccgcgttttcaata-3',如seqidno.3所示;

生物素修飾上游引物biotin-f:5'-biotin-ccggaattcctaatacgactc-3',如seqidno.4所示。

s2.ssdna文庫與hn蛋白的孵育與分離,取35.5μgssdna文庫加入到100μl結(jié)合緩沖液中(50mmtris-hcl,25mmnacl,5mmmgcl2,10mmdtt(dithiothreitol),ph7.5),95℃水浴10min后,迅速冰浴10min。為減少非特異性ssdna與膜的結(jié)合,篩選前用結(jié)合緩沖液將膜浸濕,將文庫與裝在pop-top過濾器中的硝酸纖維素膜上過濾3次,濾過的ssdna用于下一步篩選。

s3.硝酸纖維素膜篩選:將硝酸纖維素膜裝入pop-top過濾器中,并確保硝酸纖維素膜與注射器內(nèi)壁結(jié)合緊密,用結(jié)合緩沖液把膜潤濕,取上一步驟中濾過的ssdna文庫加入到hn蛋白溶液中,室溫孵育90min(每輪篩選對(duì)應(yīng)ssdna文庫量和hn蛋白量隨著篩選輪數(shù)的增加而減少)。并把核酸和蛋白孵育的溶液用過濾器過濾,然后用結(jié)合緩沖液沖洗,洗掉未與蛋白結(jié)合的寡核苷酸。

s4.反篩:在第5輪篩選時(shí)加入反篩環(huán)節(jié),即將不相關(guān)靶分子(禽流感病毒、spf雞胚雞胚尿囊液和牛血清白蛋白)包被于酶標(biāo)板中并用bsa溶液封閉,首先將ssdna和靶分子孵育溶液加入到酶標(biāo)板中,室溫孵育30min,然后再將溶液吸出加入到hn蛋白溶液中,室溫孵育。用過濾器過濾,然后用結(jié)合緩沖液沖洗,洗掉未與蛋白結(jié)合的寡核苷酸。

s5.用乙醇共沉劑回收ssdna,通過pcr擴(kuò)增目的條帶,不對(duì)稱pcr制備ssdna。獲得的ssdna作為次級(jí)文庫,用于下一輪篩選。

s6.測(cè)定每輪獲得的ssdna次級(jí)文庫的親和性,其基本原理是將洗脫的特異性ssdna序列用pcr的方法擴(kuò)增成雙鏈,瓊脂糖凝膠電泳鑒定并回收后作為模板,通過不對(duì)稱pcr方法,用帶生物素標(biāo)記的bio-f和r作為引物,大量擴(kuò)增,通過乙醇沉淀的方式回收合成的次級(jí)文庫,測(cè)濃度備用。標(biāo)記生物素的ssdna作為一抗,hrp標(biāo)記的鏈酶親和素作為二抗,用elisa的方法測(cè)定文庫與靶分子的親和性。具體步驟如下:

(1)包被抗原:將新城疫病毒hn蛋白包被微孔板,空白對(duì)照孔加入等量的包被液,4℃過夜;

(2)封閉:棄去微孔板中的液體,用pbst漂洗。加入1%的bsa封閉液37℃恒溫箱中封閉2h;

(3)加入biotin-ssdna文庫:棄去微孔板中的液體,用pbst漂洗。將處理好的各輪亞庫投入到微孔板中,每孔投入量為500pmol,37℃恒溫箱中孵育2h;

(4)加入“二抗”:棄去微孔板中的液體,用pbst漂洗。將1:5000稀釋的hrp標(biāo)記的鏈酶親和素作為“二抗”加入微孔板中,100μl/孔,37℃恒溫箱中孵育1h;

(5)顯色讀取數(shù)值:棄去微孔板中的液體,用pbst漂洗。加入100μl/孔tmb顯色后,加入等量終止液,讀取od450值。結(jié)果如圖2所示,觀察到隨著篩選輪數(shù)的增加,陽性比例增多,od450逐漸增大,而到了第9輪之后增大不明顯,且與第10輪沒有明顯的區(qū)別,表明篩選輪數(shù)增加不能再提高序列富集程度,篩選過程完成。

s7.將最后一輪篩選的次級(jí)文庫克隆、鑒定和測(cè)序,獲得核酸適配體序列。

實(shí)施例2.酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)(elisa)

將篩選獲得的核酸適配體送生工生物工程(上海)股份有限公司合成,并進(jìn)行生物素修飾,應(yīng)用elisa方法測(cè)定特異性。選取不同樣品,包被量為2μl/孔,同時(shí)設(shè)立空白對(duì)照組。4℃包被過夜,用1%的bsa37℃封閉后,將不同的生物素標(biāo)記的適配體加入孔內(nèi)進(jìn)行孵育,再加入辣根過氧化物酶標(biāo)記的親和素進(jìn)行孵育,加入底物進(jìn)行顯色,終止顯色,用酶標(biāo)儀測(cè)od450值。

圖3為selex篩選獲得的適配體b53的elisa檢測(cè),a圖表示適配體對(duì)新城疫病毒不同毒株f48e9、gm和lasota的親和力。如圖3所示,結(jié)果表明適配體b53均對(duì)新城疫病毒f48e9、gm和lasota株均具有親和力,其中對(duì)gm親和力最高;b圖表示適配體對(duì)不同病毒的親和力,結(jié)果表明,適配體b53均對(duì)ndvgm株表現(xiàn)出特異性親和,對(duì)aiv、ibdv和spf雞胚無反應(yīng)性。

實(shí)施例3..斑點(diǎn)雜交試驗(yàn)(dot-blot)

將2μlhn蛋白(1mg/ml)、gm株純化病毒、aiv、ibv、spf雞胚雞胚尿囊液點(diǎn)至nc膜中,同時(shí)設(shè)立不滴加溶液的空白對(duì)照組;待nc膜干燥后,加入3%bsa封閉液37℃搖床封閉2h,用pbst溶液洗膜;將濃度為5pmol/μl生物素標(biāo)記的ssdna,加到nc膜上,37℃搖床孵育2h后,用pbst溶液洗膜;將nc膜加入到1:5000稀釋的streptavidin-hrp溶液中,37℃恒溫?fù)u床孵育1h后,用pbst溶液洗膜3次,每次3min;dab顯示10min后終止顯色,取出膜片,觀察膜片顯色情況。

適配體特異性分析結(jié)果如圖4所示,圖4a表示適配體對(duì)新城疫病毒不同毒株f48e9、gm和lasota的結(jié)果,b53能夠特異性結(jié)合新城疫病毒不同毒株,出現(xiàn)不同灰度的斑點(diǎn)。其中g(shù)m株灰度最強(qiáng),說明適配體b53對(duì)gm的親和力比f48e9和lasota強(qiáng);圖4b表示適配體對(duì)不同病毒的結(jié)果,b53能夠特異性結(jié)合hn蛋白和新城疫病毒gm株,出現(xiàn)不同亮暗程度的斑點(diǎn),且ndv處的斑點(diǎn)比hn處淡,aiv、ibv和spf雞胚胚尿囊液處無斑點(diǎn)出現(xiàn)。說明適配體b53具有較高的特異性。結(jié)果與酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致。適配體對(duì)新城疫病毒和hn蛋白親和力分析結(jié)果如圖5所示,左圖表示適配體對(duì)不同濃度hn蛋白識(shí)別結(jié)果,右圖表示適配體對(duì)不同濃度ndv識(shí)別結(jié)果。隨著hn蛋白和gm濃度減低,dab顯色的斑點(diǎn)逐漸變暗,當(dāng)hn蛋白濃度低于0.25mg/ml、gm低于16hau時(shí),dab顯色后無斑點(diǎn)出現(xiàn)。

實(shí)施例4.血凝抑制試驗(yàn)

用結(jié)合緩沖液將適配體稀釋成50pmol/μl,95℃水浴加熱10min后立即冰浴10min,處理過后的適配體與新城疫病毒gm株室溫下孵育30min。首先取96孔微反應(yīng)板,用微量移液器在1孔~12孔每孔加入25μlpbs;然后吸取25μl適配體與病毒混合液加入到第1孔中,吹打混勻;接著從第1孔中吸取25μl混合液加入到第2孔,混勻后吸取25μl加入到第3孔,依次進(jìn)行倍比稀釋到第11孔,最后從第11孔吸取25μl棄掉,第12孔為pbs空白對(duì)照組;最后每孔加入25μl體積分?jǐn)?shù)為1%的雞紅細(xì)胞懸液,室溫下靜置15min觀察結(jié)果。同時(shí)設(shè)置病毒對(duì)照組,即用等量的結(jié)合緩沖液代替適配體與新城疫病毒室溫孵育。

如圖6所示,篩選到的優(yōu)勢(shì)適配體與gm株病毒進(jìn)行血凝抑制試驗(yàn),設(shè)置病毒對(duì)照組。結(jié)果表明適配體均具有不同程度的針對(duì)gm株病毒的血凝抑制活性,其中病毒對(duì)照組血凝效價(jià)為11log2,a1處理組的血凝效價(jià)為9log2,a3處理組的血凝效價(jià)為7log2,a20處理組的血凝效價(jià)為10log2,b7、b53和b60處理組的血凝效價(jià)為8log2。

實(shí)施例5.蝕斑抑制試驗(yàn)

將次代cef鋪于6孔細(xì)胞板,待細(xì)胞長滿單層后,吸出培養(yǎng)基,每孔依次加入450μl新城疫病毒gm株病毒稀釋液(使用dmem培養(yǎng)基10倍稀釋,稀釋倍數(shù)為10-2、10-3、10-4、10-5、10-6),并設(shè)置未接毒的空白組,加入450μl的dmem。37℃培養(yǎng)1h吸出病毒液,pbs洗滌細(xì)胞1次。接著每孔覆蓋2ml固體培養(yǎng)基(dmem/2%fbs+2%低熔點(diǎn)瓊脂糖溶液,體積比為1:1,37℃培養(yǎng)3d后,每孔加入1ml0.1%中性紅溶液,染色20min后棄染液,37℃避光培養(yǎng)1h,即可用肉眼觀察計(jì)數(shù)空斑,以能清楚識(shí)別單個(gè)蝕斑的病毒稀釋度為最佳稀釋濃度。用結(jié)合緩沖液將適配體稀釋成100pmol/μl,95℃水浴加熱10min后立即冰浴10min,處理過后的適配體與新城疫病毒gm株室溫下孵育30min,并用dmem稀釋到最佳稀釋濃度,37℃培養(yǎng)1h吸出病毒液,pbs洗滌細(xì)胞1次。接著每孔覆蓋2ml固體培養(yǎng)基(dmem/2%fbs+2%低熔點(diǎn)瓊脂糖溶液,體積比為1:1,37℃培養(yǎng)3d后,每孔加入1ml0.1%中性紅溶液,染色20min后棄染液,室溫37℃避光培養(yǎng)1-5h,即可用肉眼觀察計(jì)數(shù)空斑,同時(shí)設(shè)置等體積結(jié)合緩沖液與新城疫病毒gm室溫孵育30min的病毒對(duì)照組。

如圖7所示,數(shù)值1表示空白組,無蝕斑;數(shù)值2表示病毒對(duì)照組,蝕斑數(shù)量為52;數(shù)值3表示適配體b53處理組,蝕斑數(shù)為29。結(jié)果表明,適配體能夠減少44.2%的gm株病毒蝕斑,具有較強(qiáng)的病毒蝕斑抑制能力。

本發(fā)明的上述實(shí)施例僅為清楚地說明本發(fā)明所作的舉例,而并非是對(duì)本發(fā)明的實(shí)施方式的限定。對(duì)于所屬領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來說,在上述說明的基礎(chǔ)上還可以做出其它不同形式的變動(dòng)。這里無需也無法對(duì)所有的實(shí)施方式予以窮舉。凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi)所作的任何修改、等同替換和改進(jìn)等,均應(yīng)包含在本發(fā)明權(quán)利要求的保護(hù)范圍之內(nèi)。

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