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一種丹參素的生物生產(chǎn)方法

文檔序號(hào):524378閱讀:995來源:國知局
一種丹參素的生物生產(chǎn)方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了一種丹參素的生物生產(chǎn)方法,對(duì)羥基苯丙酮酸在對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶的催化下合成3,4-二羥基苯丙酮酸,隨后在D-乳酸脫氫酶的催化下合成丹參素;或者對(duì)羥基苯丙酮酸現(xiàn)在D-乳酸脫氫酶的催化下合成對(duì)羥基苯乳酸,然后在經(jīng)過對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶的催化,合成丹參素。本發(fā)明使用基因工程谷氨酸棒狀桿菌和大腸桿菌,進(jìn)行發(fā)酵生產(chǎn)丹參素,不需底物添加即可合成丹參素,實(shí)現(xiàn)了丹參素的從頭合成,可解決丹參素的來源問題,同時(shí)最大限度的降低了生產(chǎn)成本,有利于工業(yè)化生產(chǎn)。
【專利說明】一種丹參素的生物生產(chǎn)方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明所屬生物醫(yī)藥【技術(shù)領(lǐng)域】,涉及一種丹參素的生產(chǎn)方法,特別是丹參素的生物生產(chǎn)方法。
【背景技術(shù)】
[0002]丹參素(SalvianicacidA, Danshensu),屬于酸性芳香類化合物,其化學(xué)名為β-(3,4-二羥基苯基)乳酸,也稱丹參素甲,分子式為C9HltlO5,分子量為198.17。其多為棕黃色粉末或黃色粉末,純品為白色長針狀結(jié)晶,熔點(diǎn)84~86°C,密度1.546。最近的藥理藥效研究表明,丹參素可抑制血小板合成、聚集及釋放TXA2等縮血管物質(zhì),提高心肌耐缺氧能力,保護(hù)心肌,增加冠脈流量。這些藥理作用是丹參注射液治療冠心病、心肌缺血的主要機(jī)制。因此丹參素在心腦血管疾病方面具有非常好的功能,如:抗血栓形成,抗動(dòng)脈粥樣硬化及降血脂,擴(kuò)張冠狀動(dòng)脈,保護(hù)心肌線粒體免受氧自由基引發(fā)的脂質(zhì)過氧化物的損傷等作用。同時(shí)一些研究也發(fā)現(xiàn)其在抗菌消炎及增強(qiáng)機(jī)體免疫,防止創(chuàng)面的過度愈合,治療肝損傷,抗腦缺血損傷,素抗腫瘤,治療銀屑病等方面也有較好的作用。如天士力集團(tuán)出品的復(fù)方丹參滴丸的主要有效成分之一就是丹參素。因此,丹參素?fù)碛袕V闊的市場市場和前景。丹參素屬于酸性芳香類化合物,是丹參水溶提取物的主要活性成分之一。到目前為止,從植物丹參中提取仍是生產(chǎn)丹參素的最主要的方法。我國目前是丹參素植物提取物的主要生產(chǎn)國家。傳統(tǒng)的提取方法為水提醇沉,這也是目前制作注射液及口服液的主要提取方法。但不足之處是乙醇濃度過高,使原植物中的主要活性丹參素等酚性成分損失較大,含量不穩(wěn)定。近年來出現(xiàn)了一些新的提取技術(shù),如酶提法、CO2超臨界萃取法、微波萃取法、超聲萃取法等等。但仍然不能解決植物提取法面臨的根本問題,如植物原料受限和質(zhì)量不穩(wěn)定、生產(chǎn)能力低、種植受到季節(jié)和地理位置的限制等等。雖然已有化學(xué)全合成丹參素的報(bào)道,但步驟復(fù)雜,產(chǎn)率低,環(huán)境污染嚴(yán)重。近年來,隨著合成生物學(xué)技術(shù)的不斷進(jìn)步,使用重組微生物生產(chǎn)丹參素成為備受關(guān)注的方法。但目前為止還沒有任何文獻(xiàn)報(bào)道利用重組微生物合成丹參素。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0003]本發(fā)明的技術(shù)目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)的不足,首次設(shè)計(jì)并構(gòu)建了丹參素的生物合成途徑,并成功突破了丹參素重組微生物合成的瓶頸,提供了一種全新的丹參素的生物生產(chǎn)方法,通過構(gòu)建重組工程菌株,實(shí)現(xiàn)丹參素的從葡萄糖或者其他生物質(zhì)能源為起始的生物合成,使生產(chǎn)成本最低化。
[0004]本發(fā)明的技術(shù)目的通過下述技術(shù)方案予以實(shí)現(xiàn):
[0005]一種丹參素的生物生產(chǎn)方法,按照下述步驟進(jìn)行:
[0006]步驟1,設(shè)計(jì)·并優(yōu)化對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶(hpaB,hpaC)的基因序列,并全合成所述目標(biāo)基因;
[0007]在所述步驟I中,依據(jù)大腸桿菌BL21 (DE3)菌株的對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶(hpaB, hpaC)基因序列,設(shè)計(jì)引物并克隆,所述對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶(hpaB, hpaC)的基因序列如序列表SEQ ID N0.1所不
[0008]步驟2,設(shè)計(jì)并優(yōu)化D-乳酸脫氫酶(D-LCH)的基因序列,并全合成所述目標(biāo)基因,并經(jīng)過位點(diǎn)突變,獲得D-乳酸脫氫酶基因序列的突變基因序列D-LCH (Y52V)和D-LCH(Y52A);
[0009]在所述步驟2 中,以植物乳桿菌(Lactobacillusplantarum) ATCC14917 的 D-乳酸脫氫酶(D-LCH)基因序列作為參考,設(shè)計(jì)PCR引物,以植物乳桿菌CICC21419的基因組為模板進(jìn)行PCR反應(yīng),并克隆;所述D-乳酸脫氫酶(D-LCH)的基因序列如序列表SEQ IDN0.4所示,其對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)序列中第52位氨基酸為酪氨酸(Y,Tyr);所述D-LCH (Y52V)的DNA序列如序列表SEQ ID N0.7所不,其對(duì)應(yīng)的蛋白序列如序列表SEQID N0.8所不,與序列表SEQ IDN0.4編碼的蛋白質(zhì)相比,在第52位氨基酸突變?yōu)槔i氨酸(Val),表示為突變基因序列D-LCH (Y52V);D-LCH (Y52A)的DNA序列如序列表SEQ IDN0.9所示,其對(duì)應(yīng)的蛋白序列如序列表SEQ ID N0.10所示,與序列表SEQ ID N0.4編碼的蛋白質(zhì)相比,在第52位氨基酸突變?yōu)楸彼?Ala),表示為突變基因序列D-LCH (Y52A)。 [0010]步驟3,設(shè)計(jì)并優(yōu)化T7RNA聚合酶基因序列,并全合成所述目標(biāo)基因;
[0011]在所述步驟3中,以大腸桿菌BL21 (DE3)基因組序列中的T7RNA聚合酶序列為參考,設(shè)計(jì)PCR引物,以大腸桿菌BL21 (DE3)基因組為模板進(jìn)行PCR反應(yīng),得到T7RNA聚合酶基因以及其前面包含LacUV5啟動(dòng)子和IacI基因在內(nèi)的一部分序列,并將其克??;,所述T7RNA聚合酶基因序列如序列表SEQ ID N0.15所示,RNA聚合酶蛋白序列如序列表SEQ IDN0.16所示,并以此序列構(gòu)建表達(dá)載體。
[0012]步驟4,將獲得的對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶基因序列SEQ ID N0.1、T7RNA聚合酶基因序列SEQ ID N0.15,與D-乳酸脫氫酶基因序列SEQ ID N0.4、突變基因序列D-LCH(Y52V) SEQ ID N0.7、或者突變基因序列D-LCH (Y52A) SEQ ID N0.9之一的序列進(jìn)行配合構(gòu)建表達(dá)載體,并轉(zhuǎn)染大腸桿菌或者嵌入大腸桿菌基因組
[0013]在所述步驟4中,選擇將對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶基因序列SEQ ID N0.1分別與D-乳酸脫氫酶基因序列SEQ ID N0.4、突變基因序列D-LCH(Y52V)SEQ ID N0.7、突變基因序列 D-LCH(Y52A)SEQ ID N0.9 構(gòu)建重組質(zhì)粒(例如 pCDF-hpaBC-D-LCH、pCDF-hpaBC-D_LCH(Y52V)、pCDF-hpaBC-D-LCH (Y52A)),將上述重組質(zhì)粒分別與利用T7RNA聚合酶基因序列SEQ ID N0.15構(gòu)建的輔助質(zhì)粒(例如pECXK99E_T7)轉(zhuǎn)染大腸桿菌;所述大腸桿菌菌種名稱為SyBE-002447,建議的分類命名為大腸埃希氏菌Escherichiacoli,現(xiàn)于中國微生物菌種保藏管理委員會(huì)普通微生物中心保藏,保藏中心登記入冊(cè)編號(hào)為CGMCCN0.7962,保藏時(shí)間為2013年7月22日,地址為北京市朝陽區(qū)北辰西路I號(hào)院3號(hào)中國科學(xué)院微生物研究所,郵政編碼100101。
[0014]在所述步驟4的轉(zhuǎn)染大腸桿菌過程中,以對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶基因序列SEQ ID N0.1、T7RNA聚合酶基因序列SEQ ID N0.15與突變基因序列D-LCH (Y52A) SEQ IDN0.9轉(zhuǎn)化高產(chǎn)酪氨酸的大腸桿菌(CGMCC N0.7962)得到的工程菌,取得相對(duì)較好的丹參素產(chǎn)量,將上述工程菌進(jìn)行保藏,保藏信息如下:菌種名稱為SyBE-002444,保藏中心登記入冊(cè)編號(hào)為CGMCC N0.7961,建議的分類命名為大腸埃希氏菌Escherichia coli,現(xiàn)于中國微生物菌種保藏管理委員會(huì)普通微生物中心保藏,保藏時(shí)間為2013年7月22日,地址為北京市朝陽區(qū)北辰西路I號(hào)院3號(hào)中國科學(xué)院微生物研究所,郵政編碼100101。
[0015]在所述步驟4中,將對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶基因序列SEQ ID N0.1、突變基因序列D-LCH(Y52A)SEQ IDN0.9嵌入高產(chǎn)酪氨酸大腸桿菌(CGMCC N0.7962)基因組中,選擇將GAP啟動(dòng)子、RBS、hpaBC基因(對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶基因序列SEQ ID N0.1),D-LCH基因(突變基因序列D-LCH (Y52A) SEQ ID N0.9)和氯霉素基因序列SEQ ID N0.19利用重疊延伸方法構(gòu)造GAP-RBS-hpaBC-RBS-D-LCH的串聯(lián)片段,用λ - Red同源重組方法,將該串聯(lián)片段插入到高產(chǎn)酪氨酸的大腸桿菌(CGMCC N0.7962)基因組ybhB和ybhC基因中間,經(jīng)PCR和測序篩選得到正確菌株。
[0016]步驟5,利用步驟4得到的工程菌進(jìn)行發(fā)酵生產(chǎn)丹參素;
[0017]在所述步驟5中,選擇添加前體物對(duì)羥基苯丙酮酸和誘導(dǎo)劑異丙基-β -D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)。
[0018]本發(fā)明設(shè)計(jì)的丹參素的生物合成途徑屬于莽草酸途徑,詳細(xì)的合成途徑如下:以葡萄糖/甘油或者其他生物質(zhì)為碳源,經(jīng)莽草酸途徑合成對(duì)羥基苯丙酮酸。以芒草酸為底物合成丹參素有兩條途徑。一.對(duì)羥基苯丙酮酸在對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶(hpaB, hpaC)的催化下合成3,4-二羥基苯丙酮酸,隨后在D-乳酸脫氫酶(D-LCH)的催化下合成丹參素;二.對(duì)羥基苯丙酮酸現(xiàn)在D-乳酸脫氫酶(D-LCH)的催化下合成對(duì)羥基苯乳酸,然后在經(jīng)過對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶(hpaB,hpaC)的催化,合成丹參素。兩條途徑雖然合成的中間產(chǎn)物不一樣,但實(shí)際上起催化作用的酶是一樣的。本發(fā)明提供了一種用生物發(fā)酵生產(chǎn)丹參素的方法,使用基因工程谷氨酸棒狀桿菌和大腸桿菌,進(jìn)行發(fā)酵生產(chǎn)丹參素,不需底物添加即可合成丹參素,實(shí)現(xiàn)了丹參素的從頭合成。本發(fā)明可以解決丹參素的來源問題,同時(shí)最大限度的降低了生產(chǎn)成本,有利于工業(yè)化生產(chǎn)。 【專利附圖】

【附圖說明】
[0019]圖1是本發(fā)明使用的丹參素生物合成路線,其中I為TyrA,2為D-LCH,3為hpaB&C。圖2是本發(fā)明P⑶F-hpaBC-D-LCH質(zhì)粒構(gòu)建過程。
[0020]圖3是本發(fā)明產(chǎn)物驗(yàn)證的HPLC圖譜,其中標(biāo)準(zhǔn)品為丹參素標(biāo)準(zhǔn)品(lg/L);對(duì)照為未加IPTG誘導(dǎo)基因基因表達(dá);野生型為D-LCH基因未突變的表達(dá)載體;1為Y52V,即D-LCH(Y52V)突變的表達(dá)載體;2為Y52A,即D-LCH (Y52A)突變的表達(dá)載體。
[0021]圖4是構(gòu)建工程菌株發(fā)酵檢測結(jié)果。
【具體實(shí)施方式】
[0022]下面結(jié)合具體實(shí)施例進(jìn)一步說明本發(fā)明的技術(shù)方案。各個(gè)使用質(zhì)粒具體信息如下:質(zhì)粒pJETl.2購自北京全式金生物技術(shù)有限公司(北京市海淀區(qū)西小口路66號(hào)中關(guān)村東升科技園B-3號(hào)樓四層);質(zhì)粒pCDFDuet-l、pECXK99E、pKD46、pKD3和pcp20購自北京中原公司(北京市朝陽區(qū)東方東路11號(hào))。
[0023]實(shí)施例1高產(chǎn)L-酪氨酸菌株的篩選
[0024]以與日本交換所獲得的大腸桿菌BW25113(由日本國家遺傳研究所在2009年2月通過贈(zèng)送或交換獲得,提供者聯(lián)系方式為矢田1111,三島,靜網(wǎng)縣411-8540,日本)為出發(fā)菌株,在LB培養(yǎng)基(10g/lNaCl,10g/l蛋白胨,5g/l酵母提取物)中進(jìn)行(紫外)誘變培養(yǎng),并分離出候選菌株,進(jìn)行發(fā)酵檢測L-酪氨酸產(chǎn)量。
[0025]將50uL保存的候選菌株轉(zhuǎn)接至含有5mLpH=7.0的LB培養(yǎng)基(并加入相應(yīng)的抗生素:氨芐青霉素100ug/ml)的試管中,37°C,220rmp培養(yǎng)12h,后將500ul的過夜培養(yǎng)候選菌株轉(zhuǎn)接至含有50mlpH=7.0的LB培養(yǎng)基(并加入相應(yīng)的抗生素:氨芐青霉素100ug/ml)的250mL搖瓶中,370C,220rmp培養(yǎng)。當(dāng)0D0.6-0.8時(shí),加入終濃度為0.5mM的IPTG,繼續(xù)培養(yǎng)3h。后將菌液離心,并重新懸浮于MOPS培養(yǎng)基(5g/l葡萄糖,lg/Ι酵母提取物,K2HPO40.3g/1,NH4Cl:2.54g/l, MgCl2:0.05g/l, K2SO4:0.05g/l, FeSO4:0.0015g/l, CaCl2:0.05g/l,NaCl:3g/l, MOPS:9.24g/l,甘氨酸:0.3g/l)中,IPTG (IPTG:異丙基-β _D_ 硫代吡喃半乳糖苷,由北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司購買,地址:北京市昌平區(qū)北七家鎮(zhèn)北順工業(yè)園區(qū)東沙384號(hào))濃度為0.5mM,發(fā)酵24h后檢測酪氨酸產(chǎn)量。
[0026]發(fā)酵結(jié)束后,取ImL發(fā)酵液12000r/min離心5min,取上清,用0.22um的水系微孔濾膜過濾后進(jìn)行HPLC檢測。色譜條件如下:色譜柱:C18 (4.6X 250mm);流動(dòng)相為20%甲醇-80%水-0.1%甲酸;流速為lmL/min ;進(jìn)樣量20ul ;紫外檢測器,檢測波長為281nm。最終獲得702.7mg/l的酪氨酸,即高產(chǎn)酪氨酸菌株,建議的分類命名為大腸埃希氏菌Escherichia coli,現(xiàn)于中國微生物菌種保藏管理委員會(huì)普通微生物中心保藏,菌種名稱為SyBE-002447,保藏中心登記入冊(cè)編號(hào)為CGMCC N0.7962,地址為北京市朝陽區(qū)北辰西路I號(hào)院3號(hào)中國科學(xué)院微生物研究所,郵政編碼100101。
[0027]實(shí)施例2對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶(hpaB, hpaC)序列獲得和p⑶F_hpaBC的構(gòu)建依據(jù)大腸桿菌BL21 (DE3)菌株的對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶(hpaB,hpaC)基因序列,設(shè)計(jì)引物,并克隆(即由大腸桿菌BL21 (DE3)菌株提供對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶的基因序列)。由于對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶功能的實(shí)現(xiàn)需要hpaB和hpaC兩個(gè)基因共同完成,在BL21(DE3)基因組中, hpaB和hpaC基因是相鄰的,故克隆時(shí)是一起克隆下來并表達(dá)的。所述大腸桿菌BL21 (DE3)由北京全式金生物技術(shù)有限公司提供,北京市海淀區(qū)西小口路66號(hào)中關(guān)村東升科技園B-3號(hào)樓四層。對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶(hpaB,hpaC)的基因序列如序列表SEQ ID N0.1所示。設(shè)計(jì)引物如下:
[0028]hpaBC-U(up),如序列表 SEQ ID N0.2 所示:CGCGGATCCGATGAAACCAGAAGATTTCCGCG(下劃線部分為BamHI酶切位點(diǎn));hpaBC_D (down),如序列表SEQ ID N0.3所示:CCCAAGCTTAAATCGCAGCTTCCATTTCC (下劃線部分為 HindIII 酶切位點(diǎn))
[0029]使用FASTpfu 酶進(jìn)行 PCR,PCR 反應(yīng)條件為:95°C,5min,I 個(gè)循環(huán);95°C,30s,57°C,30s,72°C,lmin30s,共 30 個(gè)循環(huán);72°C,5min,I 個(gè)循環(huán);4°C保存。PCR 得至Ij 2000bp 左右的目標(biāo)片段。將得到的PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化后用BamHI和HindII酶進(jìn)行酶切;連接到同樣用BamHI和HindII進(jìn)行酶切的p⑶FDuet-1載體上,構(gòu)建重組質(zhì)粒p⑶F_hpaBC載體,并轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21 (DE3)感受態(tài)(需要說明的是此處僅僅用于驗(yàn)證基因的表達(dá),故可使用的大腸桿菌為一般市售的大腸桿菌即可)。37°C復(fù)蘇完成后涂布鏈霉素抗性LB平板,37°C培養(yǎng)12小時(shí)。然后以引物hpaBC-U (up,上段引物)和hpaBC-D (down,下段引物)進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證,篩選陽性克隆,并將驗(yàn)證得到的陽性克隆株進(jìn)行測序驗(yàn)證。
[0030]實(shí)施例3D-乳酸脫氫酶(D-LCH)序列獲得以及p⑶F-hpaBC-D_LCH表達(dá)載體的構(gòu)

[0031]以植物乳桿菌(Lactobacillusplantarum)ATCC14917 的 D-LCH 基因序列作為參考,設(shè)計(jì)PCR引物,以植物乳桿菌CICC21419 (在中國普通微生物菌種保藏管理中心購買,北京市朝陽區(qū)北辰西路I號(hào)院3號(hào))的基因組為模板進(jìn)行PCR反應(yīng),并克隆至pJETl.2載體上,送交測序。然后連接的以構(gòu)建好的P⑶F-hpaBC載體上,最終獲得的一個(gè)表達(dá)質(zhì)粒P⑶F-hpaBC-D-LCH。經(jīng)測序得到的D-LCH基因序列如序列表SEQIDN0.4所示,設(shè)計(jì)引物如下:
[0032]D-LCH-U (up),如序列表 SEQ ID N0.5 所示:GGGAATTCCATATGAAAATTATTGCCTATGCTGTAC (下劃線部分為NdeI酶切位點(diǎn));D-LCH-D (down),如序列表SEQ ID N0.6所示:CGGGGTACCCAGTGATAATCGAGATTAGTCAAACT (下劃線部分為 KpnI 酶切位點(diǎn))
[0033]使用FASTpfu 酶進(jìn)行 PCR,PCR 反應(yīng)條件為:95°C,5min,I 個(gè)循環(huán);95°C,30s,58°C,30s,72°C,45s,共30個(gè)循環(huán);72°C,5min, I個(gè)循環(huán);4°C保存??傻玫?000bp左右片段。將得到的PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化后,按照pJETl.2克隆試劑盒說明,將PCR片段連接到pJETl.2質(zhì)粒上得到PJETl.2-D-LCH,并轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)。37°C復(fù)蘇完成后涂布氨芐青霉素抗性LB平板,37°C培養(yǎng)12小時(shí)。然后以引物D-LCH-U (up,上段引物)和D-LCH-D (down,下段引物)進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證,篩選陽性克隆。并將驗(yàn)證得到的陽性克隆株進(jìn)行測序驗(yàn)證。提取測序正確PJET1.2-D-LCH質(zhì)粒,用Kpn I和Nde I酶進(jìn)行酶切,回收D-LCH基因片段,連接到同樣用Kpn I和Nde I酶切的pCDF_hpaBC質(zhì)粒上,構(gòu)建重組質(zhì)粒pCDF-hpaBC-D-LCH,并轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21 (DE3)感受態(tài)。37°C復(fù)蘇完成后涂布鏈霉素抗性LB平板,37°C培養(yǎng)12小時(shí)。然后以引物D-LCH-U和D-LCH-D進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證,篩選陽性克隆。并將驗(yàn)證得到的陽性克隆株進(jìn)行測序驗(yàn)證。
[0034] 實(shí)施例4D-LCH基因的突變和表達(dá)載體pCDF-hpaBC-D-LCH (Y52V)和pCDF-hpaBC-D-LCH (Y52A)的構(gòu)建
[0035]依據(jù)測序獲得的植物乳桿菌CICC21419 (在中國普通微生物菌種保藏管理中心購買,北京市朝陽區(qū)北辰西路I號(hào)院3號(hào))的D-LCH的序列設(shè)計(jì)突變引物,利用重疊延伸PCR技術(shù),獲得催化活性和底物專一性都得到提高的D-LCH (Y52V)和D-LCH (Y52A)突變基因。然后利用實(shí)施例2中類似的方法連接到pCDF-hpaBC上,獲得CDF-hpaBC-D_LCH (Y52V)和P⑶F-hpaBC-D-LCH (Y52A)表達(dá)載體。上述實(shí)施例3中的D-LCH基因序列如序列表SEQ IDN0.4所示,其對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)序列中第52位氨基酸為酪氨酸(Y,Tyr) ;D_LCH (Y52V)的DNA序列如序列表SEQ ID N0.7所不,其對(duì)應(yīng)的蛋白序列如序列表SEQIDN0.8所不,與上述實(shí)施例3的D-LCH基因序列SEQ ID N0.4對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)序列相比,在第52位氨基酸突變?yōu)槔i氨酸(Val ),表示為Y52V ;D-LCH (Y52A)的DNA序列如序列表SEQ ID N0.9所示,其對(duì)應(yīng)的蛋白序列如序列表SEQ ID N0.10所示,與上述實(shí)施例3的D-LCH基因序列SEQ ID N0.4對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)序列相比,在第52位氨基酸突變?yōu)楸彼?Ala),表示為Y52A。設(shè)計(jì)引物如下:
[0036]D-LCH-U (up),如序列表 SEQ ID N0.5 所示:GGGAATTCCATATGAAAATTATTGCCTATGCTGTAC (下劃線部分為NdeI酶切位點(diǎn));D-LCH-D (down),如序列表SEQ ID N0.6所示:CGGGGTACCCAGTGATAATCGAGATTAGTCAAACT (下劃線部分為 KpnI 酶切位點(diǎn));Y52V_D (down),如序列表 SEQ ID N0.11 所示:TTGTTGGACTACATCGGCACCGTCGAAG ;Y52V_U (up),如序列表 SEQ ID N0.12 所示:TgCCgATgTAgTCCAACAAAAggAC ;Y52A-D (down),如序列表 SEQ IDN0.13 所示:TTGTTGGGCTACATCGGCACCGTCGAAG ;Y52A_U (up),如序列表 SEQ ID N0.14 所示:TgCCgATgTAgCCCAACAAAAggAC[0037]以Y52A 的點(diǎn)突變?yōu)槔?使用 FASTpfu 酶進(jìn)行 PCR,以 D_LCH_U、Y52A-D 和 Y52A-U、D-LCH-D兩對(duì)引物分別進(jìn)行PCR反應(yīng),以P⑶F-hpaBC-D-LCH質(zhì)粒為模板。由于反應(yīng)條件相差不大,故一起做PCR反應(yīng)。PCR反應(yīng)條件為:95°C,5min,l個(gè)循環(huán);95°C,40s,58°C,30s,72°C,45s,共 30 個(gè)循環(huán);72°C,5min,l 個(gè)循環(huán);4°C保存。PCR 得到一個(gè) 200bp 和一個(gè) 800bp左右的片段。將此PCR產(chǎn)物回收后,以這兩個(gè)片段為模板,以D-LCH-U和D-LCH-D引物進(jìn)行第二輪重疊延伸PCR,應(yīng)條件如上。反應(yīng)結(jié)束后將得到一個(gè)1000bp左右的條帶。將此條帶回收后,按照實(shí)施例2中類似的方法連接到pCDF-hpaBC上,篩選陽性克隆病測序驗(yàn)證。最終獲得 pO)F-hpaBC-D-LCH (Y52V)和 pCDF-hpaBC-D-LCH (Y52A)兩個(gè)表達(dá)載體。
[0038]實(shí)施例5驗(yàn)證hpaBC基因、D-LCH基因、D-LCH (Y52V)基因、D_LCH(Y52A)基因功能
[0039]將實(shí)施例3 和 4 中獲得 pCDF-hpaBC-D-LCH、pCDF-hpaBC-D-LCH (Y52V)和pCDF-hpaBC-D-LCH (Y52A)三個(gè)表達(dá)載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21 (DE3)菌株。然后從轉(zhuǎn)化的平板中挑取單菌落到5mlLB培養(yǎng)基中過夜培養(yǎng)。然后將將100 μ L過夜培養(yǎng)的菌液轉(zhuǎn)接進(jìn)入含有50mlLB培養(yǎng)基(加入相應(yīng)的鏈霉素抗生素50ug/ml)的250ml搖瓶中,37°C,220rpm培養(yǎng)。當(dāng)菌體0D600長至0.6-0.8時(shí),加入終濃度為0.5mM的IPTG,繼續(xù)培養(yǎng)3h,然后將菌液離心,并重新懸浮于50mLM9培養(yǎng)基(M9培養(yǎng)基配方=Na2HPO4.12H20:17.lg/1 ;KH2PO4:3g/I ;NaCl:0.5g/l ;NH4Cl:lg/l ;lmol/lMgS04:2mL ;20% 葡萄糖:20mL ;lmol/lCaCl2:0.1mL)中,并補(bǔ)充500mg/L的前體物-對(duì)羥基苯丙酮酸和0.5mM的IPTG,繼續(xù)培養(yǎng)24_48h至發(fā)酵結(jié)束。同時(shí)有一瓶菌株,只加終濃度為500mg/L的對(duì)羥基苯丙酮酸而兩個(gè)發(fā)酵階段都不加0.5mM的IPTG作為對(duì)照。
[0040]發(fā)酵結(jié)束后,取ImL發(fā)酵液12000r/min離心3分鐘,取上清,用0.22 μ m的微孔濾膜過濾后進(jìn)行HPLC檢測。色譜條件如下:色譜柱:C18 (4.6X250mm);流動(dòng)相為20%甲醇-80%水-0.1%甲酸;流速lmL/min ;進(jìn)樣量20 μ L ;柱溫室溫;紫外檢測器,檢測波長281nm。依據(jù)液相的檢測結(jié)果,通過和標(biāo)準(zhǔn)品保留時(shí)間的對(duì)照,確認(rèn)合成的產(chǎn)物為丹參素,并通過峰面積的計(jì)算,最終確認(rèn)產(chǎn)量為259mg/l (如附圖3所示)。
[0041]實(shí)施例6輔助質(zhì)粒的構(gòu)造
[0042]以大腸桿菌BL21 (DE3)基因組序列中的T7RNA聚合酶序列為參考,設(shè)計(jì)PCR引物,以大腸桿菌BL21 (DE3)基因組為模板進(jìn)行PCR反應(yīng),得到T7RNA聚合酶基因以及其前面包含LacUV5啟動(dòng)子和IacI基因在內(nèi)的一部分序列,并將其克隆至pJETl.2載體上,送交測序,然后連接到PECXK99E載體上,最終獲得一個(gè)表達(dá)質(zhì)粒pECXK99E-T7RNApol。測序獲得LacUV5-lac1-T7RNApol的序列如序列表SEQ ID N0.15所示,RNA聚合酶蛋白序列如序列表SEQ ID N0.16所示。設(shè)計(jì)引物如下:T7_U (up),如序列表SEQ ID N0.17所示:CCGGAATTCTCACTCATTAGGCACCCC (下劃線部分為 EcoRI 酶切位點(diǎn));T7_D (down),如序列表SEQ ID N0.18 所示:GCAAAACTGCAGTGGCGGAGAAACCATMTTGCA (下劃線部分為 PstI 酶切位點(diǎn))
[0043]使用FASTpfu 酶進(jìn)行 PCR,PCR 反應(yīng)條件為:95°C,5min,I 個(gè)循環(huán);95°C,30s,55°C,30s,72°C,95s,共30個(gè)循環(huán);72°C,5min,I個(gè)循環(huán);4°C保存??傻玫?000bp左右片段。將得到的PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化后,按照pJETl.2克隆試劑盒說明,將PCR片段連接到pJETl.2質(zhì)粒上得到pJETl.2-T7,并轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21 (DE3)感受態(tài)。37°C復(fù)蘇完成后涂布氨芐青霉素抗性LB平板,37°C培養(yǎng)1·2小時(shí)。然后以引物T7-U和T7-D進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證,篩選陽性克隆。并將驗(yàn)證得到的陽性克隆株進(jìn)行測序驗(yàn)證。提取測序正確PJET1.2-T7質(zhì)粒,用EcoRI和PstI酶進(jìn)行酶切,回收T7基因片段,連接到同樣用EcoRI和PstI酶切的pECXK99E質(zhì)粒上,構(gòu)建重組質(zhì)粒PECXK99E-T7,并轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21 (DE3)感受態(tài)。37°C復(fù)蘇完成后涂布卡納抗性LB平板,37°C培養(yǎng)12小時(shí)。然后以引物T7-U和T7-D進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證,篩選陽性克隆。并將驗(yàn)證得到的陽性克隆株進(jìn)行測序驗(yàn)證。
[0044]實(shí)施例7生物質(zhì)碳源直接發(fā)酵法合成丹參素
[0045]分別將已構(gòu)建好的重組質(zhì)粒pCDF-hpaBC-D-LCH、pCDF-hpaBC-D-LCH (Y52V)、pCDF-hpaBC-D-LCH (Y52A)和實(shí)施例6構(gòu)建的輔助質(zhì)粒pECXK99E_T7 (提供T7RNA聚合酶)電擊轉(zhuǎn)化進(jìn)入高產(chǎn)酪氨酸的大腸桿菌菌株中(CGMCC N0.7962,詳見實(shí)施例1),得到三種工程菌。將轉(zhuǎn)化的單菌落挑至5mlLB培養(yǎng)基(加入相應(yīng)的抗生素:硫酸鏈霉素50ug/ml ;氨芐青霉素100ug/ml ;硫酸卡納霉素50ug/ml)中,37°C、220rmp過夜培養(yǎng)。后將100 μ L過夜培養(yǎng)的菌液轉(zhuǎn)接進(jìn)入含有50mlLB培養(yǎng)基(加入相應(yīng)的抗生素:硫酸鏈霉素50ug/ml ;氨芐青霉素100ug/ml ;硫酸卡納霉素50ug/ml)的250ml搖瓶中,37°C,220rpm培養(yǎng)。當(dāng)菌體0D600長至0.6-0.8時(shí),加入終濃度0.5mM的IPTG,繼續(xù)培養(yǎng)3小時(shí),后將菌液離心重新懸浮于MOPS培養(yǎng)基中,并加入終濃度為0.5mM的IPTG,繼續(xù)培養(yǎng)24_48h至發(fā)酵結(jié)束。發(fā)酵結(jié)束后按照實(shí)施例5中的檢測條件測量不同發(fā)酵時(shí)間丹參素合成的產(chǎn)量,HPLC檢測結(jié)果分析表明,所構(gòu)建的工程菌,可以高效的利用生物質(zhì)碳源,通過發(fā)酵合成丹參素,平均產(chǎn)量為6.9mg/l,其中以P⑶F-hpaBC-D-LCH (Y52A)和輔助質(zhì)粒轉(zhuǎn)化高產(chǎn)酪氨酸的大腸桿菌(CGMCC N0.7962)得到的工程菌,取得相對(duì)較好的丹參素產(chǎn)量,將上述工程菌進(jìn)行保藏,保藏信息如下:菌種名稱為SyBE-002444,保藏中心登記入冊(cè)編號(hào)為CGMCC N0.7961,建議的分類命名為大腸埃希氏菌Escherichia coli,現(xiàn)于中國微生物菌種保藏管理委員會(huì)普通微生物中心保藏,地址為北京市朝陽區(qū)北辰西路I號(hào)院3號(hào)中國科學(xué)院微生物研究所,郵政編碼100101。
[0046]實(shí)施例8將hpaBC基因和D-LCH (Y52A)基因嵌入高產(chǎn)酪氨酸大腸桿菌(CGMCCN0.7962)基因組中并發(fā)酵檢測丹參素產(chǎn)量
[0047]按照文獻(xiàn)(LimCG, Fowler ZL, Hueller T, et al.High-yield resveratrolproductionin engineered Escherichia coli[J].Applied and Environmental Microbiology, 2011,77(10):3451-3460)中已報(bào)道的GAP啟動(dòng)子的序列,大腸桿菌基因組序列以及測序的hpaBC和D-LCH基因序列設(shè)計(jì)引物,將GAP啟動(dòng)子、RBS、hpaBC基因,D-LCH基因和氯霉素基因利用重疊延伸方法構(gòu)造GAP-RBS-hpaBC-RBS-D-LCH的串聯(lián)片段,用λ - Red同源重組方法,將該串聯(lián)片段插入到高產(chǎn)酪氨酸的大腸桿菌基因組ybhB和ybhC基因中間,經(jīng)PCR和測序篩選得到正確菌株后進(jìn)行發(fā)酵檢測丹參素產(chǎn)量。使用的氯霉素基因序列如序列表SEQ ID N0.19所示,設(shè)計(jì)引物具體如下:GAP-U (up),如序列表SEQ ID N0.20所示:GCGTAATGCTTAGGCACA ;GAP-D (down),如序列表 SEQ ID N0.21 所示:TGTAATCCTCCTAAACCATGGTTCTGAATAAAAGGTTGCCTGTAA ;hpaBC_U,如序列表 SEQ ID N0.22 所示:CCATGGITTAGGAGGATTACAAAATGAAACCAGAAGATTTCC ;hpaBC_D,如序列表 SEQ ID N0.23 所示:TGTAATCCTCCTAAACCATGGTTAAATCGCAGCTTCCAT ;D-LCH_U,如序列表 SEQ ID N0.24 所示:CCATGGITTAGGAGGATTACAAAATGAAAATTATTGCCTAT ;D-LCH_D,如序列表 SEQ ID N0.25 所示:TACACAATCGCTCAAGACGTTTAGTCAAACTTAACTTGT ;C1_U, 如序列表 SEQ ID N0.26 所示:ACGTCTTGAGCGATTGTGTA ;C1_D,如序列表 SEQ ID N0.27 所示:GAATTAGCCATGGTCCATAT[0048]使用FASTpfu酶進(jìn)行PCR,以GAP-U和GAP-D為引物,以大腸桿菌BL21(DE3)基因組為模板,進(jìn)行PCR反應(yīng),PCR反應(yīng)條件為:95°C,5min,l個(gè)循環(huán);95°C,40s,60°C,30s,72°C,45s,共30個(gè)循環(huán);72°C,5min,l個(gè)循環(huán);4°C保存,獲得150bp左右的片段。以hpaBC_U,hpaBC-D 和 D-LCH-U,D-LCH-D 為兩對(duì)引物,以 pCDF-hpaBC-D-LCH (Y52A)為模板,進(jìn)行 PCR反應(yīng),PCR 反應(yīng)條件為:95°C,5min, I 個(gè)循環(huán);95°C,40s, 58°C,30s, 72°C,45s,共 30 個(gè)循環(huán);72°C,5min,I個(gè)循環(huán);4°C保存,由兩對(duì)引物分別得到2000bp和1000bp左右的片段,將PCR所獲得的三個(gè)片段進(jìn)行PCR純化回收,后以上述150bp左右的片段和2000bp左右的片段為模板,以GAP-U和hpaBC-D為引物,進(jìn)行重疊延伸PCR,PCR條件為:PCR反應(yīng)條件同上,得到2200bp左右的片段,將此片段進(jìn)行PCR回收,以此片段和上述1000左右的片段為模板,以GAP-U和D-LCH-D為引物,進(jìn)行PCR反應(yīng),反應(yīng)條件如上,獲得3200左右片段,將產(chǎn)物進(jìn)行PCR回收,按照pJETl.2克隆質(zhì)粒試劑盒說明書進(jìn)行連接,將PCR片段連接到pJETl.2質(zhì)粒上得到 PJETl.2-GAP-RBS-hpaBC-RBS-D-LCH,并轉(zhuǎn)化大腸桿菌 BL21 (DE3)感受態(tài)。37°C復(fù)蘇完成后涂布氨芐青霉素抗性LB平板,37°C培養(yǎng)12小時(shí)。然后以引物D-LCH-U和D-LCH-D進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證,篩選陽性克隆。并將驗(yàn)證得到的陽性克隆株進(jìn)行測序驗(yàn)證,結(jié)果為之前所設(shè)計(jì)的序列。
[0049]以pJETL 2-GAP-RBS-hpaBC-RBS-D-LCH 質(zhì)粒為模板,以 GAP-U 和 D-LCH-D 為引物,進(jìn)行PCR反應(yīng),反應(yīng)條件為950C,5min, I個(gè)循環(huán);95°C,40s, 58°C,30s, 72°C,45s,共30個(gè)循環(huán);72°C,5min, I 個(gè)循環(huán);4°C保存,獲得 GAP-RBS-hpaBC-RBS-D-LCH 片段。以 Cl-U 和 Cl-D為引物,以PKD3質(zhì)粒為模板,進(jìn)行PCR反應(yīng),克隆氯霉素抗性加基因,反應(yīng)條件如下:95°C,5min,l 個(gè)循環(huán);95°C,40s,55°C,30s,72°C,45s,共 30 個(gè)循環(huán);72°C,5min,I 個(gè)循環(huán);4°C保存,獲得1000bp左右片段,進(jìn)行PCR產(chǎn)物回收。以此片段和GAP-RBS-hpaBC-RBS-D-LCH片段為模板,以Cl-U和D-LCH-D為引物,進(jìn)行重疊延伸PCR,獲得4200bp左右的片段,將產(chǎn)物進(jìn)行PCR回收。
[0050]挑取含有pKD46質(zhì)粒的大腸桿菌(CGMCC N0.7962)于5mlLB培養(yǎng)基中,30°C過夜培養(yǎng)。取IOOul過夜培養(yǎng)物轉(zhuǎn)接于含有50mlLB培養(yǎng)基的250ml搖瓶中,同時(shí)添加終濃度為50ug/ml的氨芐青霉素,30°C,220rpm培養(yǎng)。當(dāng)菌體培養(yǎng)至0D600在0.1-0.2之間時(shí),加入終濃度為IOOmM的L-阿拉伯糖作為誘導(dǎo)劑,繼續(xù)培養(yǎng)至0D600約為0.6,制備電擊轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞。取5ul制備的插入片段,電擊轉(zhuǎn)化進(jìn)入制備的待電擊轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞,2.5KV,5-6ms, 37攝氏度復(fù)蘇。復(fù)蘇完成后涂布氯霉素抗性的LB的平板,過夜培養(yǎng)。第二天用Y-Up和Y-Down為引物,進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證,挑選出陽性克隆,同時(shí)以原始菌株作為對(duì)照。驗(yàn)證PCR 反應(yīng)條件為:95°C,5min,l 個(gè)循環(huán);95°C,30s,53°C,30s,72°C,lmin30s,共 30 個(gè)循環(huán);72°C,5min,l個(gè)循環(huán);4°C保存。將得到的PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序驗(yàn)證,以確?;虿迦氤晒?。將50uL測序正確的插入菌株保存的甘油菌(甘油菌保存方法為600uL甘油和600uL菌液混合,放置-20度進(jìn)行長期保藏)接入5mLLB培養(yǎng)基(加入相應(yīng)抗生素氨芐青霉素:100ug/ml)中,370C,220rmp培養(yǎng)12h。后將500ul菌液轉(zhuǎn)接至含有15mL的MOPS培養(yǎng)基中(含有5g/l葡萄糖,lg/Ι酵母提取物,并加入相應(yīng)的抗生素:100ug/ml),37°C,220rmp,當(dāng)OD=0.6-0.8時(shí),加入IPTG,每隔12h補(bǔ)充一次葡萄糖至5g/l,發(fā)酵48h后按照實(shí)施例5中的檢測條件檢測丹參素產(chǎn)量,通過HPLC檢測,最終檢測得到7.5g/l丹參素。
[0051]以上對(duì)本發(fā)明做了示例性的描述,應(yīng)該說明的是,在不脫離本發(fā)明的核心的情況下,任何簡單的變形、修改或者其他本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠不花費(fèi)創(chuàng)造性勞動(dòng)的等同替換均落入本發(fā)明的保護(hù)范 圍。
【權(quán)利要求】
1.一種丹參素的生物生產(chǎn)方法,其特征在于,按照下述步驟進(jìn)行: 步驟1,設(shè)計(jì)并優(yōu)化對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶的基因序列,并全合成所述目標(biāo)基因;所述對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶的基因序列如序列表SEQ ID N0.1所示; 步驟2,設(shè)計(jì)并優(yōu)化D-乳酸脫氫酶(D-LCH)的基因序列,并全合成所述目標(biāo)基因,并經(jīng)過位點(diǎn)突變,獲得D-乳酸脫氫酶基因序列的突變基因序列D-LCH (Y52V)和D-LCH (Y52A);所述D-乳酸脫氫酶(D-LCH)的基因序列如序列表SEQ ID N0.4所示,其對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)序列中第52位氨基酸為酪氨酸;所述D-乳酸脫氫酶基因序列的突變基因序列D-LCH (Y52V)如序列表SEQ ID N0.7所不,其對(duì)應(yīng)的蛋白序列如序列表SEQ ID N0.8所不,與序列表SEQ IDN0.4編碼的蛋白質(zhì)相比,在第52位氨基酸突變?yōu)槔i氨酸;所述D-乳酸脫氫酶基因序列的突變基因序列D-LCH (Y52A)如序列表SEQ ID N0.9所示,其對(duì)應(yīng)的蛋白序列如序列表SEQID N0.10所示,與序列表SEQ ID N0.4編碼的蛋白質(zhì)相比,在第52位氨基酸突變?yōu)楸彼幔? 步驟3,設(shè)計(jì)并優(yōu)化T7RNA聚合酶基因序列,并全合成所述目標(biāo)基因;所述T7RNA聚合酶基因序列如序列表SEQ ID N0.15所示,RNA聚合酶蛋白序列如序列表SEQ ID N0.16所示; 步驟4,將獲得的對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶基因序列SEQ ID N0.1、T7RNA聚合酶基因序列SEQ ID N0.15,與D-乳酸脫氫酶基因序列SEQ ID N0.4、D_乳酸脫氫酶基因序列的突變基因序列D-LCH (Y52V)SEQ ID N0.7、或者D-乳酸脫氫酶基因序列的突變基因序列D-LCH (Y52A) SEQ ID N0.9之一的序列進(jìn)行配合構(gòu)建表達(dá)載體,并轉(zhuǎn)染大腸桿菌或者嵌入大腸桿菌基因組;所述大腸桿菌為高產(chǎn)酪氨酸大腸桿菌,菌種名稱為SyBE-002447,建議的分類命名為大腸埃希氏菌Escherichia coli,現(xiàn)于中國微生物菌種保藏管理委員會(huì)普通微生物中心保藏,保藏中心登記入冊(cè)編號(hào)為CGMCC N0.7962 ; 步驟5,利用步驟4得到的工程菌進(jìn)行發(fā)酵生產(chǎn)丹參素。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種丹參素的生物生產(chǎn)方法,其特征在于,在所述步驟I中,選用大腸桿菌BL21 (DE3)菌株的對(duì)`羥基苯乙酸間位羥基化酶基因序列,設(shè)計(jì)引物并克隆。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種丹參素的生物生產(chǎn)方法,其特征在于,在所述步驟2中,以植物乳桿菌(Lactobacillus plantarum) ATCC14917的D-乳酸脫氫酶基因序列作為參考,設(shè)計(jì)PCR引物,以植物乳桿菌CICC21419的基因組為模板進(jìn)行PCR反應(yīng),并克隆。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種丹參素的生物生產(chǎn)方法,其特征在于,在所述步驟3中,以大腸桿菌BL2KDE3)基因組序列中的T7RNA聚合酶序列為參考,設(shè)計(jì)PCR引物,以大腸桿菌BL21 (DE3)基因組為模板進(jìn)行PCR反應(yīng),得到T7RNA聚合酶基因以及其前面包含LacUV5啟動(dòng)子和IacI基因在內(nèi)的一部分序列,并將其克隆。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種丹參素的生物生產(chǎn)方法,其特征在于,在所述步驟4中,選擇將對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶基因序列SEQ ID N0.1分別與D-乳酸脫氫酶基因序列SEQ ID N0.4、D-乳酸脫氫酶基因序列的突變基因序列D-LCH (Y52V)SEQ ID N0.7、D_乳酸脫氫酶基因序列的突變基因序列D-LCH (Y52A) SEQ ID N0.9構(gòu)建重組質(zhì)粒,將上述重組質(zhì)粒分別與利用T7RNA聚合酶基因序列SEQ ID N0.15構(gòu)建的輔助質(zhì)粒轉(zhuǎn)染大腸桿菌。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種丹參素的生物生產(chǎn)方法,其特征在于,在所述步驟4中,將對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶基因序列SEQ ID N0.1、突變基因序列D-LCH (Y52A) SEQID N0.9嵌入高產(chǎn)酪氨酸大腸桿菌(CGMCC N0.7962)基因組中,選擇將GAP啟動(dòng)子、RBS、對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶基因序列SEQ ID N0.1、D-乳酸脫氫酶基因序列的突變基因序列D-LCH (Y52A) SEQ ID N0.9和氯霉素基因序列SEQ ID N0.19利用重疊延伸方法構(gòu)造GAP-RBS-hpaBC-RBS-D-LCH的串聯(lián)片段,用λ - Red同源重組方法,將該串聯(lián)片段插入到高產(chǎn)酪氨酸的大腸桿菌(CGMCC N0.7962)基因組ybhB和ybhC基因中間,經(jīng)PCR和測序篩選得到正確菌株。
7.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種丹參素的生物生產(chǎn)方法,其特征在于,在所述步驟4的轉(zhuǎn)染大腸桿菌過程中,以對(duì)羥基苯乙酸間位羥基化酶基因序列SEQ ID N0.1、T7RNA聚合酶基因序列SEQ ID N0.15與D-乳酸脫氫酶基因序列的突變基因序列D-LCH (Y52A) SEQ IDN0.9轉(zhuǎn)化高產(chǎn)酪氨酸的大腸桿菌(CGMCC N0.7962)得到的工程菌,取得相對(duì)較好的丹參素產(chǎn)量,將上述工程菌進(jìn)行保藏,保藏信息如下:菌種名稱為SyBE-002444,保藏中心登記入冊(cè)編號(hào)為CGMCC N0.7961,建議的分類命名為大腸埃希氏菌Escherichia coli。
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種丹參素的生物生產(chǎn)方法,其特征在于,在所述步驟5中,選擇添加前體物對(duì)羥基苯丙酮酸和誘導(dǎo)劑異丙基-β -D-硫代吡喃半乳糖苷。
9.一種大腸桿菌菌種保藏登記號(hào)為CGMCC N0.7961,菌種名稱為SyBE-002444,建議的分類命名為大腸埃希氏菌Escherichia coli。
10.如權(quán)利要求9所述的菌種在制備丹參素中的應(yīng)用。
【文檔編號(hào)】C12R1/19GK103667371SQ201310559498
【公開日】2014年3月26日 申請(qǐng)日期:2013年11月11日 優(yōu)先權(quán)日:2013年11月11日
【發(fā)明者】趙廣榮, 姚元鋒, 趙瑩, 王長松 申請(qǐng)人:天津大學(xué)
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