廈門霉素生物合成基因簇、用途及菌株的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明涉及一種廈門霉素生物合成基因簇、用途及菌株。所述基因簇的堿基序列如SEQ?ID?NO.1所示,全長為5189個堿基。本發(fā)明還涉及廈門鏈霉菌(Streptomyces?xiamenensis)CGMCC?No.5670及其突變菌株;同時,本發(fā)明還涉及利用所述菌株生產(chǎn)廈門霉素的方法。本發(fā)明為利用廈門鏈霉菌及其突變菌株或攜帶有上述生物合成基因簇的基因工程菌通過生物合成來發(fā)酵生產(chǎn)苯并吡喃類化合物提供了菌種來源,且其突變菌株可用于工業(yè)生產(chǎn)。
【專利說明】廈門霉素生物合成基因簇、用途及菌株
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明屬于生物【技術(shù)領(lǐng)域】,具體涉及一種廈門霉素生物合成基因簇、用途及菌株?!颈尘凹夹g(shù)】
[0002]Streptomyces xiamenensis的模式菌株是分離自中國福建省紅樹林沉積物的一株鏈霉菌,在此菌株的發(fā)酵液中,發(fā)現(xiàn)了一苯并吡喃衍生物:
[0003]N-[[3,4-dihydro-3S-hydroxy-2S-methyl-2-(41 R-methyl-31 S-pentenyl)-2H-1-ben zopyran-6-yl] carbonyl]-threonine,結(jié)構(gòu)式如下:
[0004]
【權(quán)利要求】
1.一種廈門霉素生物合成基因簇,其特征在于,所述基因簇的堿基序列如SEQ ID N0.1所示,全長為5189個堿基。
2.如權(quán)利要求1所述的廈門霉素生物合成基因簇,其特征在于,所述基因簇包含基因ximA, ximB, ximC, ximD 和 ximE ;具體為: ximA:位于SEQ ID N0.1第1-1563堿基處,編碼520個氨基酸; ximB:位于SEQ ID N0.1第1788-2729堿基處,編碼313個氨基酸; ximC:位于SEQ ID N0.1第2795-3385堿基處,編碼196個氨基酸; ximD:位于SEQ ID N0.1第3394-4815堿基處,編碼473個氨基酸; ximE:位于SEQ ID N0.1第4815-5189堿基處,編碼124個氨基酸。
3.—種如權(quán)利要求1或2所述的廈門霉素生物合成基因簇在生產(chǎn)廈門霉素中的用途。
4.一種廈門鏈霉菌(Streptomyces xiamenensis)CGMCC N0.5670。
5.一種如權(quán)利要求4所述的廈門鏈霉菌的突變菌株,其特征在于,通過將突變型rpsL基因轉(zhuǎn)入所述廈門鏈霉菌而得。
6.如權(quán)利要求5所述的突變菌株,其特征在于,所述突變菌株為廈門鏈霉菌(Streptomyces xiamenens is)CGMCC N0.5674、廈門鏈霉菌(Streptomyces xiamenensis)CGMCC N0.5675 或廈門鏈霉菌(Sti^ptomyces xiamenensis)CGMCC N0.5676。
7.—種廈門霉素的生產(chǎn)方法,其特征在于,取如權(quán)利要求4~6中任一項所述的菌株或攜帶如權(quán)利要求1所述的廈門霉素生物合成基因簇的基因工程菌株,發(fā)酵,可得廈門霉素。
【文檔編號】C12R1/465GK103740734SQ201310273055
【公開日】2014年4月23日 申請日期:2013年7月1日 優(yōu)先權(quán)日:2013年7月1日
【發(fā)明者】徐俊, 楊勇, 付玲, 徐岷涓, 游中元 申請人:上海交通大學(xué)